Интересно, почему сабж больше 10 часов в poudriere собирается? По времени сборки он просто рекордсмен, например firefox собирается там же 4 часа, wireshark <2 часов.
Это зависимость для mate (точнее graphics/atril), как оторвать - не придумал, хотя atril не пользуюсь. В x11/mate/Makefile atril намертво вбит в RUN_DEPENDS, без опций.