Подредактировал ещё сам перед коммитом. Убрал лишний скрипт pkg-install, перенёс из него создание каталогов в основной Makefile в do-install и добавил их регистрацию в pkg-list и отсортировал его, а для файлов *.sample добавил в начало @sample, как требует Handbook.